Toutes les versions de cet article : [English] [français]
– Foundational genomic resources for date palm Phoenix dactylifera : A gap-free, telomere-to-telomere phased assembly of Ajwa and 19 high-quality genome assemblies
Traduction en français : Ressources génomiques fondamentales pour le palmier dattier (Phoenix dactylifera) : assemblage phasé sans lacune, de télomère à télomère, du cultivar ‘ʿAjwah’, et dix-neuf assemblages génomiques de haute qualité
– Article publié dans Scientific Data de Springer Nature le 31 août 2026.
– Version précédente de l’article déposée sur bioRxiv, 31 décembre 2025.
– Mirko Celii, Noor Al-Bader, Nahed Mohammed, Yong Zhou, Alice Fornasiero, Maria Navarrete Rodriguez, Raghad Shuwaikan, Umair Ali Toor, Victor Llaca, Kevin Fengler, Praveena Parakkal, Dal-Hoe Koo, Muriel Gros-Balthazard, Vincent Battesti, Thiago Capote, Michael Purugganan, Joel A. Malek, Ikram Blilou, Jesse Poland, and Rod A. Wing.
– DOI : 10.1038/s41597-026-08193-0
– En ligne : https://doi.org/10.1038/s41597-026-...
– PDF sur HAL : https://hal.science/hal-05440322
– Résumé :
Le palmier dattier (Phoenix dactylifera L.) est une culture fruitière d’une grande importance économique, nutritionnelle et culturelle dans les régions arides et semi-arides du Moyen-Orient et d’Afrique du Nord. Nous présentons ici un génome de référence sans lacune, assemblé de télomère à télomère, pour la variété ʿajwah, ainsi que dix-neuf assemblages génomiques supplémentaires de haute qualité — dix-huit femelles [dont le barnī d’al-ʿUlā] et un mâle. Ces données fournissent des assemblages chromosomiques révisés et corrigés, validés par cytogénétique, par Hi-C et par cartographie optique. La numérotation des chromosomes a été revue sur la base de leur longueur moyenne dans l’ensemble des génomes séquencés. La région de détermination du sexe (SDR) a été localisée par inférence sur le chromosome 14, où elle s’étend sur environ 15,2 Mb. Les régions organisatrices nucléolaires (NOR) ont été localisées sur le chromosome 10, où un vaste locus d’ADNr 45S présentait des motifs répétitifs uniques au sein des espaceurs, comprenant des séquences apparentées à des transposons. Chez certaines accessions, une seconde NOR a été mise en évidence sur le chromosome sexuel femelle. Cet ensemble d’assemblages génomiques du palmier dattier, structuré autour du génome de référence de la variété ʿajwah, constitue une ressource fondamentale pour le développement de stratégies d’amélioration variétale visant à renforcer la résilience génétique et la productivité du palmier dattier.
➡︎ Travail réalisé dans le cadre du projet al-ʿUlā DPA ❎.